La carrera de Freddy Martín como futbolista profesional marca 12 años de actividad como atacante con equipos de Segunda División en su natal Mérida, además de la Liga de Expansión —antes Ascenso MX—, y un breve paso por la Primera División.
Es hermano del delantero del América Henry Martín y jugó en los clubes Mérida, Venados (cuatro etapas), Alebrijes de Oaxaca y Dorados de Sinaloa (dos etapas). Con este último jugó en el Máximo Circuito en un total de 12 encuentros, de los cuales ocho fueron como titular con un gol anotado, todo esto en el torneo Clausura 2016.
El último partido profesional de Freddy fue el de la Jornada 8 del torneo Clausura 2020, cuando, en su último periodo con los Venados, entró de cambio para la segunda parte del duelo ante los Cafetaleros de Chiapas en el Estadio Carlos Iturralde.