La autoridad planteó en un Informe Circunstanciado de 543 cuartillas entregado al Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación (TEPJF) que su actuación está apegada a derecho y que la coalición impugnante no demuestra de manera "terminante u objetiva" muchas de sus acusaciones.

Un primer apartado de este Informe del IFE, presentado a través del presidente del Consejo Distrital 15, Andrés Pérez Velasco, contesta cinco agravios generales relacionados con certeza, legalidad, independencia, imparcialidad de la autoridad electoral que la coalición del PRD, PT y Convergencia ponen en duda.

Frente a éste, el IFE argumentó que la coalición, como los demás participantes de la contienda electoral, conocieron de todos los acuerdos y resolutivos emitidos por el Consejo General tendientes a la legalidad, certeza e imparcialidad en los comicios, y enlistó algunos de ellos, como el de neutralidad (el 19 de febrero) que entró en vigor el 23 de mayo; incluso, advirtió:

"El IFE no fue permisivo frente a la injerencia ilegal de un ex mandatario extranjero, el ex Presidente (del gobierno) español José María Aznar. El Instituto actuó debidamente frente a éstos hechos, sancionando al Partido Acción Nacional por el incumplimiento de sus obligaciones en materia electoral.

En un segundo punto, con alrededor de 10 agravios generales, relacionados con la aparente intervención del presidente Vicente Fox, la supuesta ventaja de precampaña para el panista Felipe Calderón Hinojosa y la influencia que habrían impreso gobiernos estatales y organismos empresariales, el IFE contestó:

"No ha lugar a considerar que el Instituto permitió la realización de actos generadores de inequidad. La anterior afirmación se puede constatar con las diversas acciones que el IFE implementó en pro de la equidad de la contienda. Se solicitó a la totalidad de los partidos la presentación de informes detallados de sus ingresos y egresos en medios. el Consejo General emitió la tregua navideña.

Respecto a declaraciones del presidente Fox interpretadas como una injerencia indebida, "el IFE no es la autoridad competente para revisar las diversas campañas publicitarias de la Presidencia de la República..

Incluso, ante las acusaciones de la coalición sobre la supuesta "utilización de programas gubernamentales en favor del PAN", el IFE, precisó: "Los alegatos del partido inconforme no logran demostrar de modo terminante que la difusión de programas sociales por parte del gobierno federal incidiera en la voluntad de los electores".

Agregó el IFE en su Informe, donde se enumeran seis agravios generales más: "Por tanto, las afirmaciones de la coalición impugnante no configuran hechos objetivos cuya veracidad sea comprobada, sino presunciones que tienen la aspiración de construir verdades legales, pero que adolecen de las pruebas y elementos objetivos para alcanzar tal propósito".

Respecto a una supuesta extralimitación de facultades del consejero presidente del IFE, Luis Carlos Ugalde, al declarar triunfador de la contienda presidencial al panista Felipe Calderón, se lee: "Durante la sesión del 6 de julio pasado, fue pública y notoria la intervención del consejero presidente repitiendo los resultados de la suma total de los cómputos distritales de Presidente de la República que había dado a conocer el secretario Ejecutivo. En virtud de que dicho pronunciamiento fue realizado en forma posterior a que el propio secretario cumpliera con el mandato, es de considerarse que en ningún momento el consejero presidente usurpó funciones, toda vez que se limitó a repetir, en la primera ronda de intervenciones, los datos difundidos por el secretario ejecutivo".